De acuerdo al último Informe de Circulación de Variantes elaborado por el Departamento de Epidemiología del Ministerio de Salud, durante el mes de junio (hasta el día 25) el Instituto de Salud Pública de Chile (ISP), ha secuenciado 336 genomas completos de casos de Sars-CoV-2. A ellos se suman el anásilis de otras 123 muestras de la Red UC CHRISTUS (resultados mediante RT-qPCR de mutaciones asociadas a variantes). En total, se han analizado 459 muestras de casos Sars-CoV-2 hasta el 25 de junio, según fecha de procesamiento.

De ellas, se identificaron 344 casos de variantes de preocupación (74,9%); la variante Gamma (brasileña) fue identificada en 334 muestras distribuidas de Arica y Parinacota hasta Aysén, concentrándose mayormente en la Región Metropolitana (176), en la región de Libertador Bernardo O’Higgins (44) y Arica (26).

La variante Alfa (británica) fue identificada en 9 muestras, distribuidas en las regiones de Antofagasta, Atacama, Valparaíso, Metropolitana, del Libertador Bernardo O’Higgins y Biobío. La variante Delta, fue identificada en una muestra correspondiente a una persona de la Región del Maule el 24 de junio.

Gráfico de la circulación de Variantes en Chile, según informa Minsal. Desde el mes de abril, la variante andina está disminuyendo su presencia frente a la variante surgida en Brasil.

Sin ser considerada una variante de preocupación, pero sí de interés, la variante Lambda o “Andina”, se identificó en 85 muestras de variantes de interés de para la salud pública (18,5%). 82 de esas muestras se encontraron en residentes de las regiones de Antofagasta, Atacama, Coquimbo, Valparaíso, Metropolitana de Santiago, Libertador Bernardo O’Higgins, Maule, Ñuble, Araucanía, Los Ríos y Los Lagos. concentrándose mayormente en la región de Libertador Bernardo O’Higgins (28) y en la región Metropolitana (18). Las otras tres muestras, corresponden a la variante Epsilon en residentes de la región Metropolitana de Santiago y de la región de la Araucanía.

Variación en el tiempo

Desde diciembre del año pasado, al 25 de junio de 2021 se han analizado a nivel nacional 3.441 muestras de casos confirmados de Sars-CoV-2 de los cuales se han obtenidos las secuencias que permiten realizar análisis genómico.

Las variantes de preocupación (VOC) se presentan en un 51,0% (n=1.756) y las de interés en Salud Pública (VOI) en un 26,5% (n=911) del total de muestras de casos secuenciados.

En cuanto a las VOC, la principal es Gamma (1.479 muestras), lo que representa un 84,2% del total de las variantes de preocupación y casi la mitad de las muestras secuenciadas (43%). Respecto a las VOI o varaintes de interés, la que más se ha detectado es Lambda, que representa un 91,9% (837 muestras) del total y el 24,3% de todas las secuenciaciones realizadas desde el 25 de diciembre al 25 de junio.

Muestras secuenciadas desde diciembre del año pasado a fines de junio de este año. Detección de variantes en viajeros y circulación comunitaria.